堆制方法，按原料的不同，有机菌基材厂家，分高温堆肥和普通堆肥。高温堆肥以纤维含量较高的植物物质为主要原料，有机菌基材，在通气条件下堆制发酵，产生大量热量，堆内温度高（50～60℃），有机菌基材电话，因而腐熟快，堆制快，养分含量高。高温发酵过程中能其中的病菌、虫卵和杂草种子。普通堆肥一般掺入较多泥土，发酵温度低，腐熟过程慢，堆制时间长。堆制中使养分化学组成改变，碳氮比值降低，能被植物直接吸收的矿质营养成分增多，并形成腐殖质。
20世纪20年代，又有一些新的微生物制剂用于大田土壤和农作物，但效果不甚理想。20世纪40年代，美国颁发了生物杀虫剂---，至今已有20多种不同的微生物产品为这一目的而使用。
1937年，有机菌基材报价，苏联微生物学家克拉西尼科夫和密苏斯金研制了“固氮菌剂”。从而了---肥料的先河，由于种种原因，这种微生物肥料都先后停止了---生产。1940年前后，亚洲研制了一种以蓝---（藻类）为主而用于稻田的生物肥料。现在其在持续农业中仍然发挥着---的作用。
沼气肥
作物秸秆、青草和人粪尿等在沼气池中经微生物发酵制取沼气后的残留物。富含有机质和需的营养元素。沼气发酵慢，有机质消耗较少，氮、磷、钾损失少，氮素回收率达百分之95、钾在百分之90以上。沼气水肥作旱地追肥；渣肥作水田基肥，若作旱地基肥施后应复土。沼气肥出池后应堆放数日后再用(因沼肥的还原性强，出池后立即使用，会与作物争夺土壤中的氧气，导致作物叶片发黄、凋萎)。
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